咽喉是進行飲食、呼吸、發聲音的器官。咽喉上連口鼻，下通肺胃，是連接口腔和肺胃的通路，又為經脈循行的要沖。
咽喉的主要生理功能有以下幾點：
1、呼吸功能
咽喉不單只是呼吸時氣流出入的通道，它對吸入的空氣還有溫濕度調節和清潔作用。同時，在大腦的調節下聲門作為空氣出入肺部的必經之路，可根據人體生命活動需氧量的增減而發生寬窄變化，入聲門在人平均呼吸時較小，運動或情緒激動時，聲門擴張，以便增加肺部氣體交換。
2、發聲功能
正常人發生時，先吸入空氣，聲帶內收，拉緊，聲門閉合，當氣流自肺部呼出沖擊聲帶時，使之震動而發出聲音。經過咽腔和口腔改變形狀，鼻腔與胸腔參與，產生共鳴，使聲音清晰，和諧悅耳，并有軟腭、口、舌、唇、齒等協同作用，形成各種語音。聲調的高低取決于聲帶的長度、張力和呼出氣流的力量。
3、免疫和保護功能
咽部有扁桃體，特別在兒童期，是個活躍的免疫器官。對從血液、淋巴或其他組織侵入機體的有害物質具有積極的防御作用。幼兒3~5周歲時，因接觸外界便應原的機會較多，扁桃體顯著增大。故此年齡段的孩子扁桃體肥大應視為正常生理性現象。青春期后，扁桃體的免疫活動趨于減退，組織本身也逐漸縮小。腺樣體也是個免疫器官，但作用較小。
總結：咽部的嘔吐和喉部的劇咳等生理性神經反射，均可迫使異物排出，以起到保護消化道和呼吸道的作用，而且喉部的會厭軟骨把持在食管口與下呼吸道口之間，像個活塞蓋，嚴格控制使食物與空氣能夠各行其道。
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